На заседании президиума Ойротского облисполкома, протокол № 20 от 9 мая 1936 года, впервые был поставлен вопрос о необходимости открытия в городе Ойрот-Туре медицинского техникума. В решении говорилось: «Ввиду огромной нужды Ойротской области в кадрах медицинских работников средней квалификации и особенно из местного коренного населения, просить Народный Комиссариат Здравоохранения открыть в 1936-37 учебном году в городе Ойрот-Туре на базе областной больницы медицинский техникум в составе двух отделений: фельдшерско-акушерского, и акушерского с контингентом первый год 40 человек, с доведением в последующие годы количество учащихся до 120 человек». В архивных документах Горно-Алтайского облздравотдела содержится документ с планом лечебно профилактической сети города Ойрот-Тура на 3-ю пятилетку. В нем на 1938 год предусмотрен медтехникум с числом студентов 60, на 1939 г.- 120 студентов, на 1940 г. – 180 студентов, на 1941 г. и последующие годы 240 студентов. По свидетельству известного исследователя истории средних учебных заведений области - Нины Васильевны Белоусовой, годом создания Ойротской двухгодичной школы медицинских сестер считается 1936 год, а первый набор студентов состоялся в 1937 году. Через год она была переименована в фельдшерско-акушерскую школу. Первый выпуск состоялся в 1939 году. Было подготовлено 77 медицинских сестер. В связи с переименованием Ойротской автономной области в Горно-Алтайскую с 1948 года, медицинская школа стала называться Горно-Алтайская фельдшерско-акушерская школа. В этом же году для улучшения условий подготовки специалистов из коренного населения при ней был открыт интернат с содержанием за счет государства. В 1954 году фельдшерско-акушерская школа была реорганизована в медицинское училище. Постановлением Администрации города Горно-Алтайска от 19.05.1998 №81/123, в соответствии с Гражданским Кодексом Российской Федерации, на основании решения Госкомитета по управлению имуществом Республики Алтай от 05.02.1998г. №3 и приказа по Министерству здравоохранения Республики Алтай №35 от 20.04.1998 г. зарегистрировано государственное учреждение «Горно-Алтайское медицинское училище» для подготовки специалистов среднего медицинского звена, повышения квалификации и создания системы непрерывной профессиональной подготовки медицинских кадров. Приказом Министерства здравоохранения Республики Алтай №249 от 14.12.2004 г. государственное учреждение «Горно-Алтайское медицинское училище» переименовано в государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Горно-Алтайское медицинское училище». Постановлением правительства РА №168 от 25.07.2011 г. государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Горно-Алтайское медицинское училище» переименовано в Бюджетное учреждение среднего профессионального образования Республики Алтай «Медицинское училище». Постановлением правительства РА №374 от 30.12.2013 г. Бюджетное учреждение среднего профессионального образования Республики Алтай «Медицинское училище» переименованоо в Буджетное профессиональное образовательное учреждение Республики Алтай "Медицинский колледж".